실시간 지급계좌에 있는 돈도 회사 자산으로 보는 건가요?

네, 맞습니다.

사장님이 직접 관리하고 사용하는 돈이기 때문에, 회계상으로도 “회사 자산(보통예금)”으로 잡아야 맞습니다.